Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

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Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms