Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r34G3XA52 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r34G3XA52 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r34G3XA52 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r34G3XA52 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r34G3XA52 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Vmn1r34G3XA52 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Vmn1r34G3XA52 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Vmn1r34G3XA52 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Vmn1r34G3XA52 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Vmn1r34G3XA52 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Vmn1r34G3XA52 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Vmn1r34G3XA52 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Vmn1r34G3XA52 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Vmn1r34G3XA52 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Vmn1r34G3XA52 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Vmn1r34G3XA52 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r34G3XA52 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r34G3XA52 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r34G3XA52 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r34G3XA52 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r34G3XA52 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r34G3XA52 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r34G3XA52 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r34G3XA52 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r34G3XA52 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r34G3XA52 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r34G3XA52 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r34G3XA52 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r34G3XA52 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r34G3XA52 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r34G3XA52 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r34G3XA52 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r34G3XA52 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r34G3XA52 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r34G3XA52 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r34G3XA52 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r34G3XA52 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r34G3XA52 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r34G3XA52 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r34G3XA52 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r34G3XA52 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r34G3XA52 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r34G3XA52 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r34G3XA52 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r34G3XA52 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r34G3XA52 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r34G3XA52 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r34G3XA52 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r34G3XA52 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r34G3XA52 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r34G3XA52 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r34G3XA52 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r34G3XA52 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r34G3XA52 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r34G3XA52 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r34G3XA52 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r34G3XA52 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r34G3XA52 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r34G3XA52 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r34G3XA52 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r34G3XA52 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r34G3XA52 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r34G3XA52 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r34G3XA52 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r34G3XA52 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r34G3XA52 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r34G3XA52 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r34G3XA52 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r34G3XA52 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r34G3XA52 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r34G3XA52 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r34G3XA52 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r34G3XA52 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r34G3XA52 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r34G3XA52 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r34G3XA52 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r34G3XA52 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r34G3XA52 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r34G3XA52 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r34G3XA52 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r34G3XA52 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r34G3XA52 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r34G3XA52 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r34G3XA52 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r34G3XA52 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r34G3XA52 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r34G3XA52 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r34G3XA52 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r34G3XA52 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r34G3XA52 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vmn1r34G3XA52 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vmn1r34G3XA52 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vmn1r34G3XA52 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vmn1r34G3XA52 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vmn1r34G3XA52 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vmn1r34G3XA52 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vmn1r34G3XA52 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vmn1r34G3XA52 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vmn1r34G3XA52 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms