Protein–RNA interactions for Protein: G3X9M3

Hmgxb3, HMG box domain-containing 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgxb3G3X9M3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms