Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM8

Xntrpc, Xndc1-transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 2 readthrough, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XntrpcF8VQM8 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
XntrpcF8VQM8 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
XntrpcF8VQM8 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
XntrpcF8VQM8 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
XntrpcF8VQM8 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
XntrpcF8VQM8 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
XntrpcF8VQM8 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
XntrpcF8VQM8 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
XntrpcF8VQM8 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
XntrpcF8VQM8 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
XntrpcF8VQM8 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
XntrpcF8VQM8 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
XntrpcF8VQM8 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
XntrpcF8VQM8 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
XntrpcF8VQM8 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
XntrpcF8VQM8 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
XntrpcF8VQM8 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
XntrpcF8VQM8 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
XntrpcF8VQM8 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
XntrpcF8VQM8 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
XntrpcF8VQM8 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
XntrpcF8VQM8 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
XntrpcF8VQM8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
XntrpcF8VQM8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
XntrpcF8VQM8 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
XntrpcF8VQM8 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
XntrpcF8VQM8 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
XntrpcF8VQM8 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
XntrpcF8VQM8 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
XntrpcF8VQM8 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
XntrpcF8VQM8 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
XntrpcF8VQM8 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
XntrpcF8VQM8 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
XntrpcF8VQM8 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
XntrpcF8VQM8 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
XntrpcF8VQM8 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
XntrpcF8VQM8 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
XntrpcF8VQM8 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
XntrpcF8VQM8 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
XntrpcF8VQM8 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
XntrpcF8VQM8 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
XntrpcF8VQM8 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
XntrpcF8VQM8 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
XntrpcF8VQM8 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
XntrpcF8VQM8 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
XntrpcF8VQM8 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
XntrpcF8VQM8 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
XntrpcF8VQM8 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
XntrpcF8VQM8 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
XntrpcF8VQM8 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
XntrpcF8VQM8 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
XntrpcF8VQM8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
XntrpcF8VQM8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
XntrpcF8VQM8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
XntrpcF8VQM8 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
XntrpcF8VQM8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
XntrpcF8VQM8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
XntrpcF8VQM8 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
XntrpcF8VQM8 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
XntrpcF8VQM8 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
XntrpcF8VQM8 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
XntrpcF8VQM8 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
XntrpcF8VQM8 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
XntrpcF8VQM8 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
XntrpcF8VQM8 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
XntrpcF8VQM8 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
XntrpcF8VQM8 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
XntrpcF8VQM8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
XntrpcF8VQM8 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
XntrpcF8VQM8 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
XntrpcF8VQM8 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
XntrpcF8VQM8 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
XntrpcF8VQM8 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
XntrpcF8VQM8 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
XntrpcF8VQM8 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
XntrpcF8VQM8 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
XntrpcF8VQM8 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
XntrpcF8VQM8 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
XntrpcF8VQM8 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
XntrpcF8VQM8 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
XntrpcF8VQM8 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
XntrpcF8VQM8 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
XntrpcF8VQM8 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
XntrpcF8VQM8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
XntrpcF8VQM8 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
XntrpcF8VQM8 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
XntrpcF8VQM8 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
XntrpcF8VQM8 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
XntrpcF8VQM8 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
XntrpcF8VQM8 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
XntrpcF8VQM8 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
XntrpcF8VQM8 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
XntrpcF8VQM8 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
XntrpcF8VQM8 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
XntrpcF8VQM8 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
XntrpcF8VQM8 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
XntrpcF8VQM8 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
XntrpcF8VQM8 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
XntrpcF8VQM8 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
XntrpcF8VQM8 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms