Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ63

Vmn1r76, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r76F8VQ63 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r76F8VQ63 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r76F8VQ63 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r76F8VQ63 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r76F8VQ63 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r76F8VQ63 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r76F8VQ63 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r76F8VQ63 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r76F8VQ63 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r76F8VQ63 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r76F8VQ63 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r76F8VQ63 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r76F8VQ63 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r76F8VQ63 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r76F8VQ63 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r76F8VQ63 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r76F8VQ63 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r76F8VQ63 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r76F8VQ63 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r76F8VQ63 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r76F8VQ63 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r76F8VQ63 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r76F8VQ63 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r76F8VQ63 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r76F8VQ63 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r76F8VQ63 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r76F8VQ63 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r76F8VQ63 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r76F8VQ63 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r76F8VQ63 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r76F8VQ63 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r76F8VQ63 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r76F8VQ63 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r76F8VQ63 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r76F8VQ63 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r76F8VQ63 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r76F8VQ63 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r76F8VQ63 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms