Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Farp1F8VPU2 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Farp1F8VPU2 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Farp1F8VPU2 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Farp1F8VPU2 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Farp1F8VPU2 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Farp1F8VPU2 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Farp1F8VPU2 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Farp1F8VPU2 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Farp1F8VPU2 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Farp1F8VPU2 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Farp1F8VPU2 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Farp1F8VPU2 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Farp1F8VPU2 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Farp1F8VPU2 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Farp1F8VPU2 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Farp1F8VPU2 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Farp1F8VPU2 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Farp1F8VPU2 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Farp1F8VPU2 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Farp1F8VPU2 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Farp1F8VPU2 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Farp1F8VPU2 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Farp1F8VPU2 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Farp1F8VPU2 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Farp1F8VPU2 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Farp1F8VPU2 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Farp1F8VPU2 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Farp1F8VPU2 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Farp1F8VPU2 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Farp1F8VPU2 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Farp1F8VPU2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Farp1F8VPU2 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Farp1F8VPU2 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Farp1F8VPU2 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Farp1F8VPU2 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Farp1F8VPU2 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Farp1F8VPU2 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Farp1F8VPU2 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Farp1F8VPU2 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Farp1F8VPU2 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Farp1F8VPU2 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Farp1F8VPU2 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Farp1F8VPU2 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Farp1F8VPU2 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Farp1F8VPU2 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Farp1F8VPU2 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Farp1F8VPU2 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Farp1F8VPU2 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Farp1F8VPU2 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Farp1F8VPU2 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Farp1F8VPU2 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Farp1F8VPU2 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Farp1F8VPU2 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Farp1F8VPU2 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Farp1F8VPU2 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Farp1F8VPU2 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Farp1F8VPU2 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Farp1F8VPU2 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Farp1F8VPU2 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Farp1F8VPU2 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Farp1F8VPU2 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Farp1F8VPU2 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Farp1F8VPU2 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Farp1F8VPU2 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Farp1F8VPU2 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Farp1F8VPU2 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Farp1F8VPU2 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Farp1F8VPU2 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Farp1F8VPU2 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Farp1F8VPU2 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Farp1F8VPU2 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Farp1F8VPU2 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Farp1F8VPU2 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Farp1F8VPU2 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Farp1F8VPU2 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Farp1F8VPU2 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Farp1F8VPU2 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Farp1F8VPU2 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Farp1F8VPU2 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Farp1F8VPU2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Farp1F8VPU2 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Farp1F8VPU2 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Farp1F8VPU2 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Farp1F8VPU2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Farp1F8VPU2 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Farp1F8VPU2 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Farp1F8VPU2 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Farp1F8VPU2 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Farp1F8VPU2 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Farp1F8VPU2 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Farp1F8VPU2 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Farp1F8VPU2 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Farp1F8VPU2 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms