Protein–RNA interactions for Protein: F7CQW8

Gm3371, Predicted gene 3371 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3371F7CQW8 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3371F7CQW8 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3371F7CQW8 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3371F7CQW8 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3371F7CQW8 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3371F7CQW8 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3371F7CQW8 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3371F7CQW8 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3371F7CQW8 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3371F7CQW8 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3371F7CQW8 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3371F7CQW8 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3371F7CQW8 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3371F7CQW8 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3371F7CQW8 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3371F7CQW8 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3371F7CQW8 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3371F7CQW8 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3371F7CQW8 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3371F7CQW8 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3371F7CQW8 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3371F7CQW8 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3371F7CQW8 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3371F7CQW8 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3371F7CQW8 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3371F7CQW8 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3371F7CQW8 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3371F7CQW8 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3371F7CQW8 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3371F7CQW8 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3371F7CQW8 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3371F7CQW8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3371F7CQW8 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3371F7CQW8 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3371F7CQW8 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3371F7CQW8 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3371F7CQW8 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3371F7CQW8 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3371F7CQW8 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3371F7CQW8 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3371F7CQW8 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3371F7CQW8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3371F7CQW8 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3371F7CQW8 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3371F7CQW8 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3371F7CQW8 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3371F7CQW8 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm3371F7CQW8 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm3371F7CQW8 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm3371F7CQW8 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm3371F7CQW8 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm3371F7CQW8 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm3371F7CQW8 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms