Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Gm28038F7BCN9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Gm28038F7BCN9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Gm28038F7BCN9 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Gm28038F7BCN9 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Gm28038F7BCN9 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Gm28038F7BCN9 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Gm28038F7BCN9 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Gm28038F7BCN9 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
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