Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm8005F6YKY3 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm8005F6YKY3 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm8005F6YKY3 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm8005F6YKY3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm8005F6YKY3 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm8005F6YKY3 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm8005F6YKY3 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm8005F6YKY3 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm8005F6YKY3 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm8005F6YKY3 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm8005F6YKY3 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm8005F6YKY3 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm8005F6YKY3 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm8005F6YKY3 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm8005F6YKY3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm8005F6YKY3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm8005F6YKY3 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm8005F6YKY3 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm8005F6YKY3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm8005F6YKY3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm8005F6YKY3 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm8005F6YKY3 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm8005F6YKY3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm8005F6YKY3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm8005F6YKY3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm8005F6YKY3 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm8005F6YKY3 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm8005F6YKY3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm8005F6YKY3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm8005F6YKY3 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm8005F6YKY3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm8005F6YKY3 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm8005F6YKY3 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm8005F6YKY3 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm8005F6YKY3 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm8005F6YKY3 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm8005F6YKY3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm8005F6YKY3 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm8005F6YKY3 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm8005F6YKY3 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm8005F6YKY3 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm8005F6YKY3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm8005F6YKY3 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm8005F6YKY3 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm8005F6YKY3 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm8005F6YKY3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm8005F6YKY3 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm8005F6YKY3 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm8005F6YKY3 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm8005F6YKY3 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm8005F6YKY3 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm8005F6YKY3 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm8005F6YKY3 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm8005F6YKY3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm8005F6YKY3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm8005F6YKY3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm8005F6YKY3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm8005F6YKY3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm8005F6YKY3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm8005F6YKY3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm8005F6YKY3 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm8005F6YKY3 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm8005F6YKY3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm8005F6YKY3 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm8005F6YKY3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm8005F6YKY3 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm8005F6YKY3 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm8005F6YKY3 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm8005F6YKY3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm8005F6YKY3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm8005F6YKY3 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm8005F6YKY3 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm8005F6YKY3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm8005F6YKY3 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm8005F6YKY3 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm8005F6YKY3 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm8005F6YKY3 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm8005F6YKY3 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm8005F6YKY3 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm8005F6YKY3 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm8005F6YKY3 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm8005F6YKY3 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm8005F6YKY3 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm8005F6YKY3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm8005F6YKY3 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm8005F6YKY3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm8005F6YKY3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm8005F6YKY3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm8005F6YKY3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm8005F6YKY3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm8005F6YKY3 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm8005F6YKY3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm8005F6YKY3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm8005F6YKY3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm8005F6YKY3 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm8005F6YKY3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm8005F6YKY3 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm8005F6YKY3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm8005F6YKY3 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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