Protein–RNA interactions for Protein: F6XS56

Gm8444, Predicted gene 8444, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8444F6XS56 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms