Protein–RNA interactions for Protein: F6U8B9

Gm17555, Predicted gene, 17555, mousemouse

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Length 371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17555F6U8B9 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Gm17555F6U8B9 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
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Gm17555F6U8B9 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Gm17555F6U8B9 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Gm17555F6U8B9 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Gm17555F6U8B9 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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