Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3U3

Raph1, Ras association (RalGDS/AF-6) and pleckstrin homology domains 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Raph1F2Z3U3 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Raph1F2Z3U3 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Raph1F2Z3U3 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Raph1F2Z3U3 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Raph1F2Z3U3 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Raph1F2Z3U3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Raph1F2Z3U3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Raph1F2Z3U3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Raph1F2Z3U3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Raph1F2Z3U3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Raph1F2Z3U3 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Raph1F2Z3U3 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Raph1F2Z3U3 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Raph1F2Z3U3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Raph1F2Z3U3 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Raph1F2Z3U3 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Raph1F2Z3U3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Raph1F2Z3U3 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Raph1F2Z3U3 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Raph1F2Z3U3 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Raph1F2Z3U3 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Raph1F2Z3U3 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Raph1F2Z3U3 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Raph1F2Z3U3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Raph1F2Z3U3 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Raph1F2Z3U3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Raph1F2Z3U3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Raph1F2Z3U3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Raph1F2Z3U3 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Raph1F2Z3U3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Raph1F2Z3U3 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Raph1F2Z3U3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Raph1F2Z3U3 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Raph1F2Z3U3 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Raph1F2Z3U3 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Raph1F2Z3U3 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Raph1F2Z3U3 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Raph1F2Z3U3 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Raph1F2Z3U3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Raph1F2Z3U3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Raph1F2Z3U3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Raph1F2Z3U3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Raph1F2Z3U3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Raph1F2Z3U3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Raph1F2Z3U3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Raph1F2Z3U3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Raph1F2Z3U3 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Raph1F2Z3U3 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Raph1F2Z3U3 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Raph1F2Z3U3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Raph1F2Z3U3 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Raph1F2Z3U3 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Raph1F2Z3U3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Raph1F2Z3U3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Raph1F2Z3U3 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Raph1F2Z3U3 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Raph1F2Z3U3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Raph1F2Z3U3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Raph1F2Z3U3 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Raph1F2Z3U3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Raph1F2Z3U3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Raph1F2Z3U3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Raph1F2Z3U3 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Raph1F2Z3U3 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Raph1F2Z3U3 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Raph1F2Z3U3 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Raph1F2Z3U3 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Raph1F2Z3U3 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Raph1F2Z3U3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Raph1F2Z3U3 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Raph1F2Z3U3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Raph1F2Z3U3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Raph1F2Z3U3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Raph1F2Z3U3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Raph1F2Z3U3 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Raph1F2Z3U3 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Raph1F2Z3U3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Raph1F2Z3U3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Raph1F2Z3U3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Raph1F2Z3U3 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Raph1F2Z3U3 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Raph1F2Z3U3 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Raph1F2Z3U3 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Raph1F2Z3U3 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Raph1F2Z3U3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Raph1F2Z3U3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Raph1F2Z3U3 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Raph1F2Z3U3 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Raph1F2Z3U3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Raph1F2Z3U3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Raph1F2Z3U3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Raph1F2Z3U3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Raph1F2Z3U3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Raph1F2Z3U3 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Raph1F2Z3U3 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Raph1F2Z3U3 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Raph1F2Z3U3 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Raph1F2Z3U3 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Raph1F2Z3U3 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Raph1F2Z3U3 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms