Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

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Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Ccdc7bE9Q9Y3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Ccdc7bE9Q9Y3 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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