Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9W7

Pdzd7, PDZ domain-containing 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd7E9Q9W7 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzd7E9Q9W7 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzd7E9Q9W7 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzd7E9Q9W7 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzd7E9Q9W7 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzd7E9Q9W7 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd7E9Q9W7 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd7E9Q9W7 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd7E9Q9W7 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd7E9Q9W7 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd7E9Q9W7 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd7E9Q9W7 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd7E9Q9W7 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd7E9Q9W7 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd7E9Q9W7 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd7E9Q9W7 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd7E9Q9W7 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd7E9Q9W7 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd7E9Q9W7 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd7E9Q9W7 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd7E9Q9W7 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd7E9Q9W7 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd7E9Q9W7 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd7E9Q9W7 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd7E9Q9W7 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd7E9Q9W7 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd7E9Q9W7 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd7E9Q9W7 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd7E9Q9W7 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd7E9Q9W7 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd7E9Q9W7 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd7E9Q9W7 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd7E9Q9W7 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd7E9Q9W7 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd7E9Q9W7 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd7E9Q9W7 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd7E9Q9W7 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd7E9Q9W7 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd7E9Q9W7 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd7E9Q9W7 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd7E9Q9W7 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd7E9Q9W7 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzd7E9Q9W7 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzd7E9Q9W7 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzd7E9Q9W7 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzd7E9Q9W7 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzd7E9Q9W7 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzd7E9Q9W7 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzd7E9Q9W7 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzd7E9Q9W7 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzd7E9Q9W7 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzd7E9Q9W7 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzd7E9Q9W7 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzd7E9Q9W7 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzd7E9Q9W7 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzd7E9Q9W7 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzd7E9Q9W7 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzd7E9Q9W7 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzd7E9Q9W7 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzd7E9Q9W7 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzd7E9Q9W7 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzd7E9Q9W7 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzd7E9Q9W7 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzd7E9Q9W7 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzd7E9Q9W7 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzd7E9Q9W7 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzd7E9Q9W7 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzd7E9Q9W7 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzd7E9Q9W7 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzd7E9Q9W7 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms