Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U0

Usp17lb, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lbE9Q9U0 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms