Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms