Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8F9

6030445D17Rik, RIKEN cDNA 6030445D17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6030445D17RikE9Q8F9 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms