Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BC005561E9Q5E2 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BC005561E9Q5E2 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
BC005561E9Q5E2 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BC005561E9Q5E2 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BC005561E9Q5E2 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
BC005561E9Q5E2 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BC005561E9Q5E2 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BC005561E9Q5E2 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BC005561E9Q5E2 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BC005561E9Q5E2 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BC005561E9Q5E2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BC005561E9Q5E2 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BC005561E9Q5E2 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BC005561E9Q5E2 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BC005561E9Q5E2 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BC005561E9Q5E2 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BC005561E9Q5E2 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BC005561E9Q5E2 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BC005561E9Q5E2 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
BC005561E9Q5E2 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BC005561E9Q5E2 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
BC005561E9Q5E2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BC005561E9Q5E2 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BC005561E9Q5E2 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BC005561E9Q5E2 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BC005561E9Q5E2 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BC005561E9Q5E2 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BC005561E9Q5E2 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BC005561E9Q5E2 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BC005561E9Q5E2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BC005561E9Q5E2 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BC005561E9Q5E2 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
BC005561E9Q5E2 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
BC005561E9Q5E2 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BC005561E9Q5E2 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BC005561E9Q5E2 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BC005561E9Q5E2 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BC005561E9Q5E2 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BC005561E9Q5E2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BC005561E9Q5E2 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BC005561E9Q5E2 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BC005561E9Q5E2 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BC005561E9Q5E2 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BC005561E9Q5E2 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BC005561E9Q5E2 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BC005561E9Q5E2 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BC005561E9Q5E2 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
BC005561E9Q5E2 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
BC005561E9Q5E2 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BC005561E9Q5E2 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BC005561E9Q5E2 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BC005561E9Q5E2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BC005561E9Q5E2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BC005561E9Q5E2 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BC005561E9Q5E2 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BC005561E9Q5E2 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BC005561E9Q5E2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BC005561E9Q5E2 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BC005561E9Q5E2 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BC005561E9Q5E2 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
BC005561E9Q5E2 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
BC005561E9Q5E2 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BC005561E9Q5E2 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BC005561E9Q5E2 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BC005561E9Q5E2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BC005561E9Q5E2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BC005561E9Q5E2 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BC005561E9Q5E2 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BC005561E9Q5E2 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BC005561E9Q5E2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BC005561E9Q5E2 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BC005561E9Q5E2 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BC005561E9Q5E2 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BC005561E9Q5E2 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BC005561E9Q5E2 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BC005561E9Q5E2 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BC005561E9Q5E2 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BC005561E9Q5E2 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BC005561E9Q5E2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BC005561E9Q5E2 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BC005561E9Q5E2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BC005561E9Q5E2 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
BC005561E9Q5E2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
BC005561E9Q5E2 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BC005561E9Q5E2 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BC005561E9Q5E2 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
BC005561E9Q5E2 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
BC005561E9Q5E2 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BC005561E9Q5E2 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BC005561E9Q5E2 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BC005561E9Q5E2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BC005561E9Q5E2 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BC005561E9Q5E2 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
BC005561E9Q5E2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BC005561E9Q5E2 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
BC005561E9Q5E2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BC005561E9Q5E2 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC24■■□□□ 1.43
BC005561E9Q5E2 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BC005561E9Q5E2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms