Protein–RNA interactions for Protein: E9Q492

Pgbd1, PiggyBac transposable element-derived 1, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgbd1E9Q492 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pgbd1E9Q492 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pgbd1E9Q492 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms