Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3P4

Cenpf, Centromere protein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpfE9Q3P4 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CenpfE9Q3P4 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CenpfE9Q3P4 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CenpfE9Q3P4 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CenpfE9Q3P4 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CenpfE9Q3P4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CenpfE9Q3P4 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CenpfE9Q3P4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CenpfE9Q3P4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CenpfE9Q3P4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CenpfE9Q3P4 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CenpfE9Q3P4 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CenpfE9Q3P4 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CenpfE9Q3P4 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CenpfE9Q3P4 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CenpfE9Q3P4 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CenpfE9Q3P4 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CenpfE9Q3P4 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CenpfE9Q3P4 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CenpfE9Q3P4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CenpfE9Q3P4 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CenpfE9Q3P4 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CenpfE9Q3P4 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CenpfE9Q3P4 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CenpfE9Q3P4 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CenpfE9Q3P4 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CenpfE9Q3P4 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CenpfE9Q3P4 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CenpfE9Q3P4 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CenpfE9Q3P4 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CenpfE9Q3P4 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CenpfE9Q3P4 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CenpfE9Q3P4 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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CenpfE9Q3P4 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CenpfE9Q3P4 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CenpfE9Q3P4 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CenpfE9Q3P4 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CenpfE9Q3P4 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CenpfE9Q3P4 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CenpfE9Q3P4 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CenpfE9Q3P4 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CenpfE9Q3P4 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CenpfE9Q3P4 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CenpfE9Q3P4 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CenpfE9Q3P4 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CenpfE9Q3P4 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CenpfE9Q3P4 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CenpfE9Q3P4 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CenpfE9Q3P4 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CenpfE9Q3P4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CenpfE9Q3P4 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CenpfE9Q3P4 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CenpfE9Q3P4 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CenpfE9Q3P4 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CenpfE9Q3P4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CenpfE9Q3P4 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CenpfE9Q3P4 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CenpfE9Q3P4 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CenpfE9Q3P4 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CenpfE9Q3P4 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CenpfE9Q3P4 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CenpfE9Q3P4 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CenpfE9Q3P4 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CenpfE9Q3P4 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms