Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Zfp558E9Q1J0 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
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Zfp558E9Q1J0 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Zfp558E9Q1J0 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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