Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms