Protein–RNA interactions for Protein: E9Q058

Gm3095, Predicted gene 3095, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3095E9Q058 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms