Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM7

Scaf11, SR-related CTD-associated factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf11E9PZM7 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scaf11E9PZM7 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scaf11E9PZM7 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scaf11E9PZM7 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scaf11E9PZM7 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Scaf11E9PZM7 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scaf11E9PZM7 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scaf11E9PZM7 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scaf11E9PZM7 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scaf11E9PZM7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scaf11E9PZM7 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scaf11E9PZM7 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scaf11E9PZM7 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scaf11E9PZM7 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scaf11E9PZM7 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scaf11E9PZM7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scaf11E9PZM7 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scaf11E9PZM7 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scaf11E9PZM7 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scaf11E9PZM7 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scaf11E9PZM7 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scaf11E9PZM7 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Scaf11E9PZM7 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scaf11E9PZM7 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scaf11E9PZM7 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scaf11E9PZM7 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scaf11E9PZM7 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scaf11E9PZM7 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scaf11E9PZM7 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scaf11E9PZM7 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scaf11E9PZM7 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scaf11E9PZM7 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scaf11E9PZM7 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scaf11E9PZM7 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scaf11E9PZM7 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scaf11E9PZM7 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scaf11E9PZM7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scaf11E9PZM7 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scaf11E9PZM7 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scaf11E9PZM7 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scaf11E9PZM7 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scaf11E9PZM7 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scaf11E9PZM7 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scaf11E9PZM7 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scaf11E9PZM7 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scaf11E9PZM7 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Scaf11E9PZM7 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scaf11E9PZM7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scaf11E9PZM7 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scaf11E9PZM7 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scaf11E9PZM7 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scaf11E9PZM7 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scaf11E9PZM7 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scaf11E9PZM7 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Scaf11E9PZM7 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scaf11E9PZM7 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scaf11E9PZM7 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scaf11E9PZM7 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scaf11E9PZM7 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scaf11E9PZM7 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scaf11E9PZM7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scaf11E9PZM7 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scaf11E9PZM7 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Scaf11E9PZM7 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scaf11E9PZM7 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scaf11E9PZM7 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scaf11E9PZM7 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scaf11E9PZM7 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scaf11E9PZM7 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scaf11E9PZM7 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scaf11E9PZM7 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scaf11E9PZM7 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scaf11E9PZM7 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scaf11E9PZM7 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scaf11E9PZM7 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scaf11E9PZM7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scaf11E9PZM7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scaf11E9PZM7 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scaf11E9PZM7 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scaf11E9PZM7 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scaf11E9PZM7 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scaf11E9PZM7 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scaf11E9PZM7 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scaf11E9PZM7 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scaf11E9PZM7 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scaf11E9PZM7 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scaf11E9PZM7 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Scaf11E9PZM7 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scaf11E9PZM7 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scaf11E9PZM7 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scaf11E9PZM7 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scaf11E9PZM7 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Scaf11E9PZM7 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scaf11E9PZM7 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scaf11E9PZM7 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scaf11E9PZM7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scaf11E9PZM7 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scaf11E9PZM7 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scaf11E9PZM7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scaf11E9PZM7 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms