Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms