Protein–RNA interactions for Protein: E9PXF3

Gm5415, Predicted gene 5415, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5415E9PXF3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5415E9PXF3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5415E9PXF3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5415E9PXF3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5415E9PXF3 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5415E9PXF3 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5415E9PXF3 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5415E9PXF3 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5415E9PXF3 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5415E9PXF3 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5415E9PXF3 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5415E9PXF3 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5415E9PXF3 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5415E9PXF3 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5415E9PXF3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5415E9PXF3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5415E9PXF3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5415E9PXF3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5415E9PXF3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5415E9PXF3 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5415E9PXF3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5415E9PXF3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5415E9PXF3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5415E9PXF3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5415E9PXF3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5415E9PXF3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5415E9PXF3 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5415E9PXF3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5415E9PXF3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5415E9PXF3 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5415E9PXF3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5415E9PXF3 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5415E9PXF3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5415E9PXF3 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5415E9PXF3 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5415E9PXF3 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5415E9PXF3 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5415E9PXF3 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5415E9PXF3 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5415E9PXF3 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5415E9PXF3 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5415E9PXF3 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5415E9PXF3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5415E9PXF3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5415E9PXF3 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5415E9PXF3 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5415E9PXF3 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5415E9PXF3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5415E9PXF3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5415E9PXF3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5415E9PXF3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5415E9PXF3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5415E9PXF3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5415E9PXF3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5415E9PXF3 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5415E9PXF3 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5415E9PXF3 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5415E9PXF3 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5415E9PXF3 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5415E9PXF3 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5415E9PXF3 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5415E9PXF3 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5415E9PXF3 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5415E9PXF3 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5415E9PXF3 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5415E9PXF3 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5415E9PXF3 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5415E9PXF3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5415E9PXF3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5415E9PXF3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5415E9PXF3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5415E9PXF3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5415E9PXF3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5415E9PXF3 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5415E9PXF3 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5415E9PXF3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5415E9PXF3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5415E9PXF3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5415E9PXF3 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5415E9PXF3 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5415E9PXF3 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5415E9PXF3 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5415E9PXF3 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5415E9PXF3 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5415E9PXF3 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5415E9PXF3 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5415E9PXF3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5415E9PXF3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5415E9PXF3 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5415E9PXF3 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5415E9PXF3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5415E9PXF3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5415E9PXF3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5415E9PXF3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5415E9PXF3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5415E9PXF3 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5415E9PXF3 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5415E9PXF3 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5415E9PXF3 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5415E9PXF3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms