Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms