Protein–RNA interactions for Protein: E9PVL6

Trim30b, Tripartite motif-containing 30B, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30bE9PVL6 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Trim30bE9PVL6 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim30bE9PVL6 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim30bE9PVL6 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim30bE9PVL6 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim30bE9PVL6 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim30bE9PVL6 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim30bE9PVL6 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim30bE9PVL6 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim30bE9PVL6 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim30bE9PVL6 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim30bE9PVL6 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim30bE9PVL6 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim30bE9PVL6 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim30bE9PVL6 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim30bE9PVL6 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim30bE9PVL6 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim30bE9PVL6 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim30bE9PVL6 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim30bE9PVL6 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim30bE9PVL6 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim30bE9PVL6 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim30bE9PVL6 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim30bE9PVL6 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim30bE9PVL6 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim30bE9PVL6 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim30bE9PVL6 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim30bE9PVL6 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim30bE9PVL6 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim30bE9PVL6 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim30bE9PVL6 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim30bE9PVL6 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim30bE9PVL6 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim30bE9PVL6 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim30bE9PVL6 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim30bE9PVL6 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim30bE9PVL6 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim30bE9PVL6 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim30bE9PVL6 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim30bE9PVL6 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim30bE9PVL6 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim30bE9PVL6 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim30bE9PVL6 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim30bE9PVL6 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim30bE9PVL6 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim30bE9PVL6 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim30bE9PVL6 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim30bE9PVL6 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim30bE9PVL6 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim30bE9PVL6 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim30bE9PVL6 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim30bE9PVL6 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim30bE9PVL6 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim30bE9PVL6 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim30bE9PVL6 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim30bE9PVL6 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim30bE9PVL6 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim30bE9PVL6 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim30bE9PVL6 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim30bE9PVL6 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim30bE9PVL6 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim30bE9PVL6 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim30bE9PVL6 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim30bE9PVL6 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim30bE9PVL6 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim30bE9PVL6 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim30bE9PVL6 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim30bE9PVL6 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim30bE9PVL6 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim30bE9PVL6 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim30bE9PVL6 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim30bE9PVL6 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim30bE9PVL6 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim30bE9PVL6 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim30bE9PVL6 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim30bE9PVL6 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim30bE9PVL6 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim30bE9PVL6 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim30bE9PVL6 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim30bE9PVL6 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim30bE9PVL6 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim30bE9PVL6 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim30bE9PVL6 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim30bE9PVL6 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim30bE9PVL6 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim30bE9PVL6 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim30bE9PVL6 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim30bE9PVL6 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim30bE9PVL6 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim30bE9PVL6 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim30bE9PVL6 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim30bE9PVL6 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim30bE9PVL6 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim30bE9PVL6 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim30bE9PVL6 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim30bE9PVL6 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim30bE9PVL6 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim30bE9PVL6 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim30bE9PVL6 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim30bE9PVL6 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms