Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD1

Ccdc62, Coiled-coil domain-containing protein 62, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc62E9PVD1 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms