Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ttc17E9PVB5 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ttc17E9PVB5 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ttc17E9PVB5 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ttc17E9PVB5 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ttc17E9PVB5 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ttc17E9PVB5 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ttc17E9PVB5 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ttc17E9PVB5 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ttc17E9PVB5 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ttc17E9PVB5 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ttc17E9PVB5 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ttc17E9PVB5 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ttc17E9PVB5 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ttc17E9PVB5 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ttc17E9PVB5 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ttc17E9PVB5 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ttc17E9PVB5 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ttc17E9PVB5 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ttc17E9PVB5 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ttc17E9PVB5 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ttc17E9PVB5 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ttc17E9PVB5 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ttc17E9PVB5 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ttc17E9PVB5 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ttc17E9PVB5 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttc17E9PVB5 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttc17E9PVB5 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttc17E9PVB5 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttc17E9PVB5 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttc17E9PVB5 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttc17E9PVB5 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttc17E9PVB5 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttc17E9PVB5 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttc17E9PVB5 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttc17E9PVB5 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttc17E9PVB5 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttc17E9PVB5 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttc17E9PVB5 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttc17E9PVB5 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttc17E9PVB5 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttc17E9PVB5 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttc17E9PVB5 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttc17E9PVB5 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttc17E9PVB5 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttc17E9PVB5 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttc17E9PVB5 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttc17E9PVB5 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttc17E9PVB5 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttc17E9PVB5 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttc17E9PVB5 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttc17E9PVB5 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttc17E9PVB5 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttc17E9PVB5 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttc17E9PVB5 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttc17E9PVB5 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttc17E9PVB5 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttc17E9PVB5 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttc17E9PVB5 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttc17E9PVB5 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttc17E9PVB5 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttc17E9PVB5 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttc17E9PVB5 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttc17E9PVB5 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttc17E9PVB5 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttc17E9PVB5 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttc17E9PVB5 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttc17E9PVB5 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttc17E9PVB5 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttc17E9PVB5 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttc17E9PVB5 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttc17E9PVB5 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttc17E9PVB5 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttc17E9PVB5 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttc17E9PVB5 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttc17E9PVB5 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttc17E9PVB5 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttc17E9PVB5 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttc17E9PVB5 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttc17E9PVB5 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms