Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms