Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms