Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc6D3YZP9 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc6D3YZP9 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc6D3YZP9 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc6D3YZP9 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc6D3YZP9 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc6D3YZP9 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc6D3YZP9 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc6D3YZP9 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc6D3YZP9 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc6D3YZP9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc6D3YZP9 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc6D3YZP9 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc6D3YZP9 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc6D3YZP9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc6D3YZP9 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc6D3YZP9 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc6D3YZP9 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc6D3YZP9 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc6D3YZP9 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc6D3YZP9 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc6D3YZP9 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc6D3YZP9 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc6D3YZP9 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc6D3YZP9 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc6D3YZP9 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc6D3YZP9 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc6D3YZP9 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc6D3YZP9 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc6D3YZP9 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc6D3YZP9 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc6D3YZP9 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc6D3YZP9 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc6D3YZP9 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc6D3YZP9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc6D3YZP9 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc6D3YZP9 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc6D3YZP9 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc6D3YZP9 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc6D3YZP9 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc6D3YZP9 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc6D3YZP9 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc6D3YZP9 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc6D3YZP9 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc6D3YZP9 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc6D3YZP9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc6D3YZP9 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc6D3YZP9 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc6D3YZP9 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc6D3YZP9 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc6D3YZP9 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc6D3YZP9 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc6D3YZP9 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc6D3YZP9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc6D3YZP9 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc6D3YZP9 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc6D3YZP9 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc6D3YZP9 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc6D3YZP9 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc6D3YZP9 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc6D3YZP9 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc6D3YZP9 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc6D3YZP9 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc6D3YZP9 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc6D3YZP9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc6D3YZP9 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc6D3YZP9 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc6D3YZP9 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc6D3YZP9 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc6D3YZP9 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc6D3YZP9 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc6D3YZP9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc6D3YZP9 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc6D3YZP9 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc6D3YZP9 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc6D3YZP9 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc6D3YZP9 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc6D3YZP9 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc6D3YZP9 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc6D3YZP9 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc6D3YZP9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc6D3YZP9 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc6D3YZP9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc6D3YZP9 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc6D3YZP9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc6D3YZP9 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc6D3YZP9 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc6D3YZP9 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc6D3YZP9 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc6D3YZP9 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc6D3YZP9 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc6D3YZP9 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc6D3YZP9 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc6D3YZP9 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc6D3YZP9 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc6D3YZP9 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc6D3YZP9 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc6D3YZP9 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc6D3YZP9 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc6D3YZP9 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms