Protein–RNA interactions for Protein: D3YXJ9

Cldn24, Claudin, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn24D3YXJ9 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn24D3YXJ9 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn24D3YXJ9 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn24D3YXJ9 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn24D3YXJ9 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn24D3YXJ9 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn24D3YXJ9 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn24D3YXJ9 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn24D3YXJ9 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn24D3YXJ9 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn24D3YXJ9 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn24D3YXJ9 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn24D3YXJ9 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn24D3YXJ9 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn24D3YXJ9 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn24D3YXJ9 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn24D3YXJ9 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn24D3YXJ9 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn24D3YXJ9 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn24D3YXJ9 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn24D3YXJ9 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn24D3YXJ9 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn24D3YXJ9 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn24D3YXJ9 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn24D3YXJ9 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn24D3YXJ9 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn24D3YXJ9 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn24D3YXJ9 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn24D3YXJ9 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn24D3YXJ9 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn24D3YXJ9 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn24D3YXJ9 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn24D3YXJ9 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn24D3YXJ9 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn24D3YXJ9 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn24D3YXJ9 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn24D3YXJ9 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn24D3YXJ9 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn24D3YXJ9 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn24D3YXJ9 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn24D3YXJ9 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn24D3YXJ9 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn24D3YXJ9 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn24D3YXJ9 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn24D3YXJ9 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn24D3YXJ9 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn24D3YXJ9 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn24D3YXJ9 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn24D3YXJ9 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn24D3YXJ9 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn24D3YXJ9 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn24D3YXJ9 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn24D3YXJ9 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn24D3YXJ9 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn24D3YXJ9 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn24D3YXJ9 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn24D3YXJ9 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn24D3YXJ9 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn24D3YXJ9 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn24D3YXJ9 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn24D3YXJ9 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn24D3YXJ9 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn24D3YXJ9 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn24D3YXJ9 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn24D3YXJ9 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn24D3YXJ9 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn24D3YXJ9 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn24D3YXJ9 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn24D3YXJ9 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn24D3YXJ9 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn24D3YXJ9 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn24D3YXJ9 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn24D3YXJ9 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn24D3YXJ9 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn24D3YXJ9 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn24D3YXJ9 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn24D3YXJ9 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn24D3YXJ9 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn24D3YXJ9 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn24D3YXJ9 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn24D3YXJ9 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn24D3YXJ9 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn24D3YXJ9 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn24D3YXJ9 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn24D3YXJ9 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn24D3YXJ9 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn24D3YXJ9 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn24D3YXJ9 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn24D3YXJ9 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn24D3YXJ9 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn24D3YXJ9 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn24D3YXJ9 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn24D3YXJ9 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn24D3YXJ9 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn24D3YXJ9 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn24D3YXJ9 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn24D3YXJ9 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn24D3YXJ9 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn24D3YXJ9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn24D3YXJ9 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.8 ms