Protein–RNA interactions for Protein: D3YUM8

Gm4950, Proteasome subunit beta type, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4950D3YUM8 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm4950D3YUM8 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm4950D3YUM8 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm4950D3YUM8 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm4950D3YUM8 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm4950D3YUM8 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm4950D3YUM8 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm4950D3YUM8 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm4950D3YUM8 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm4950D3YUM8 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm4950D3YUM8 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm4950D3YUM8 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm4950D3YUM8 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm4950D3YUM8 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm4950D3YUM8 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm4950D3YUM8 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm4950D3YUM8 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm4950D3YUM8 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm4950D3YUM8 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm4950D3YUM8 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm4950D3YUM8 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm4950D3YUM8 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm4950D3YUM8 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm4950D3YUM8 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm4950D3YUM8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm4950D3YUM8 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm4950D3YUM8 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm4950D3YUM8 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm4950D3YUM8 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm4950D3YUM8 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm4950D3YUM8 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm4950D3YUM8 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm4950D3YUM8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm4950D3YUM8 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm4950D3YUM8 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm4950D3YUM8 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm4950D3YUM8 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm4950D3YUM8 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm4950D3YUM8 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm4950D3YUM8 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm4950D3YUM8 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm4950D3YUM8 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm4950D3YUM8 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm4950D3YUM8 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm4950D3YUM8 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm4950D3YUM8 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm4950D3YUM8 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm4950D3YUM8 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm4950D3YUM8 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm4950D3YUM8 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm4950D3YUM8 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm4950D3YUM8 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm4950D3YUM8 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm4950D3YUM8 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm4950D3YUM8 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm4950D3YUM8 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms