Protein–RNA interactions for Protein: D3YU81

Rfx8, DNA-binding protein RFX8, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx8D3YU81 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rfx8D3YU81 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rfx8D3YU81 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rfx8D3YU81 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rfx8D3YU81 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rfx8D3YU81 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rfx8D3YU81 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rfx8D3YU81 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rfx8D3YU81 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rfx8D3YU81 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rfx8D3YU81 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rfx8D3YU81 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rfx8D3YU81 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rfx8D3YU81 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rfx8D3YU81 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rfx8D3YU81 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rfx8D3YU81 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rfx8D3YU81 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfx8D3YU81 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfx8D3YU81 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfx8D3YU81 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfx8D3YU81 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfx8D3YU81 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfx8D3YU81 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfx8D3YU81 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfx8D3YU81 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfx8D3YU81 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Rfx8D3YU81 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Rfx8D3YU81 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfx8D3YU81 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Rfx8D3YU81 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfx8D3YU81 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfx8D3YU81 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfx8D3YU81 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfx8D3YU81 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfx8D3YU81 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfx8D3YU81 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfx8D3YU81 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfx8D3YU81 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Rfx8D3YU81 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Rfx8D3YU81 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rfx8D3YU81 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rfx8D3YU81 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
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Rfx8D3YU81 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rfx8D3YU81 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Rfx8D3YU81 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rfx8D3YU81 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rfx8D3YU81 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Rfx8D3YU81 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rfx8D3YU81 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rfx8D3YU81 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rfx8D3YU81 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rfx8D3YU81 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Rfx8D3YU81 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Rfx8D3YU81 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rfx8D3YU81 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rfx8D3YU81 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rfx8D3YU81 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rfx8D3YU81 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rfx8D3YU81 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rfx8D3YU81 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rfx8D3YU81 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rfx8D3YU81 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rfx8D3YU81 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rfx8D3YU81 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rfx8D3YU81 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rfx8D3YU81 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rfx8D3YU81 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rfx8D3YU81 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rfx8D3YU81 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rfx8D3YU81 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rfx8D3YU81 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rfx8D3YU81 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rfx8D3YU81 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rfx8D3YU81 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rfx8D3YU81 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rfx8D3YU81 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rfx8D3YU81 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms