Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmf1B9EKI3 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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