Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clip3B9EHT4 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms