Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms