Protein–RNA interactions for Protein: B2RT89

Slc22a28, Predicted gene, EG434674, mousemouse

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Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a28B2RT89 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc22a28B2RT89 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc22a28B2RT89 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc22a28B2RT89 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc22a28B2RT89 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc22a28B2RT89 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc22a28B2RT89 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc22a28B2RT89 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc22a28B2RT89 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc22a28B2RT89 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc22a28B2RT89 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc22a28B2RT89 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc22a28B2RT89 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc22a28B2RT89 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc22a28B2RT89 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc22a28B2RT89 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc22a28B2RT89 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc22a28B2RT89 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc22a28B2RT89 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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