Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms