Protein–RNA interactions for Protein: A6X8J8

Gm15821, Novel protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm15821A6X8J8 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm15821A6X8J8 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm15821A6X8J8 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm15821A6X8J8 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm15821A6X8J8 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm15821A6X8J8 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm15821A6X8J8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm15821A6X8J8 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm15821A6X8J8 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm15821A6X8J8 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm15821A6X8J8 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm15821A6X8J8 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm15821A6X8J8 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm15821A6X8J8 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm15821A6X8J8 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm15821A6X8J8 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm15821A6X8J8 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm15821A6X8J8 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm15821A6X8J8 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm15821A6X8J8 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm15821A6X8J8 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm15821A6X8J8 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm15821A6X8J8 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm15821A6X8J8 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm15821A6X8J8 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm15821A6X8J8 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm15821A6X8J8 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm15821A6X8J8 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm15821A6X8J8 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm15821A6X8J8 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm15821A6X8J8 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm15821A6X8J8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm15821A6X8J8 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm15821A6X8J8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm15821A6X8J8 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm15821A6X8J8 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm15821A6X8J8 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm15821A6X8J8 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm15821A6X8J8 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm15821A6X8J8 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm15821A6X8J8 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm15821A6X8J8 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm15821A6X8J8 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm15821A6X8J8 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm15821A6X8J8 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm15821A6X8J8 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm15821A6X8J8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm15821A6X8J8 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm15821A6X8J8 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm15821A6X8J8 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm15821A6X8J8 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm15821A6X8J8 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm15821A6X8J8 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm15821A6X8J8 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm15821A6X8J8 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm15821A6X8J8 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm15821A6X8J8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm15821A6X8J8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm15821A6X8J8 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm15821A6X8J8 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm15821A6X8J8 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm15821A6X8J8 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm15821A6X8J8 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm15821A6X8J8 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm15821A6X8J8 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm15821A6X8J8 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm15821A6X8J8 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm15821A6X8J8 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm15821A6X8J8 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm15821A6X8J8 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm15821A6X8J8 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm15821A6X8J8 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm15821A6X8J8 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm15821A6X8J8 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm15821A6X8J8 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm15821A6X8J8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm15821A6X8J8 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm15821A6X8J8 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm15821A6X8J8 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm15821A6X8J8 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm15821A6X8J8 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm15821A6X8J8 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm15821A6X8J8 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm15821A6X8J8 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm15821A6X8J8 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm15821A6X8J8 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm15821A6X8J8 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm15821A6X8J8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm15821A6X8J8 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm15821A6X8J8 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm15821A6X8J8 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm15821A6X8J8 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm15821A6X8J8 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm15821A6X8J8 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm15821A6X8J8 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm15821A6X8J8 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm15821A6X8J8 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm15821A6X8J8 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm15821A6X8J8 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm15821A6X8J8 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms