Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Frmpd1A2AKB4 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Frmpd1A2AKB4 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Frmpd1A2AKB4 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Frmpd1A2AKB4 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Frmpd1A2AKB4 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Frmpd1A2AKB4 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Frmpd1A2AKB4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Frmpd1A2AKB4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Frmpd1A2AKB4 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Frmpd1A2AKB4 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Frmpd1A2AKB4 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Frmpd1A2AKB4 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Frmpd1A2AKB4 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Frmpd1A2AKB4 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Frmpd1A2AKB4 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Frmpd1A2AKB4 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Frmpd1A2AKB4 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Frmpd1A2AKB4 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Frmpd1A2AKB4 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Frmpd1A2AKB4 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Frmpd1A2AKB4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Frmpd1A2AKB4 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Frmpd1A2AKB4 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Frmpd1A2AKB4 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Frmpd1A2AKB4 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Frmpd1A2AKB4 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Frmpd1A2AKB4 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Frmpd1A2AKB4 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Frmpd1A2AKB4 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Frmpd1A2AKB4 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Frmpd1A2AKB4 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Frmpd1A2AKB4 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Frmpd1A2AKB4 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Frmpd1A2AKB4 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Frmpd1A2AKB4 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Frmpd1A2AKB4 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Frmpd1A2AKB4 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Frmpd1A2AKB4 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
Frmpd1A2AKB4 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Frmpd1A2AKB4 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
Frmpd1A2AKB4 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Frmpd1A2AKB4 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Frmpd1A2AKB4 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Frmpd1A2AKB4 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Frmpd1A2AKB4 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Frmpd1A2AKB4 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Frmpd1A2AKB4 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Frmpd1A2AKB4 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Frmpd1A2AKB4 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Frmpd1A2AKB4 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Frmpd1A2AKB4 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Frmpd1A2AKB4 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Frmpd1A2AKB4 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Frmpd1A2AKB4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Frmpd1A2AKB4 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Frmpd1A2AKB4 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Frmpd1A2AKB4 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Frmpd1A2AKB4 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Frmpd1A2AKB4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Frmpd1A2AKB4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Frmpd1A2AKB4 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Frmpd1A2AKB4 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Frmpd1A2AKB4 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Frmpd1A2AKB4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Frmpd1A2AKB4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Frmpd1A2AKB4 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Frmpd1A2AKB4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Frmpd1A2AKB4 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Frmpd1A2AKB4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Frmpd1A2AKB4 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Frmpd1A2AKB4 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Frmpd1A2AKB4 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Frmpd1A2AKB4 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Frmpd1A2AKB4 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Frmpd1A2AKB4 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Frmpd1A2AKB4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Frmpd1A2AKB4 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Frmpd1A2AKB4 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Frmpd1A2AKB4 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Frmpd1A2AKB4 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Frmpd1A2AKB4 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Frmpd1A2AKB4 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Frmpd1A2AKB4 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Frmpd1A2AKB4 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Frmpd1A2AKB4 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Frmpd1A2AKB4 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Frmpd1A2AKB4 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Frmpd1A2AKB4 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Frmpd1A2AKB4 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Frmpd1A2AKB4 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Frmpd1A2AKB4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Frmpd1A2AKB4 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Frmpd1A2AKB4 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Frmpd1A2AKB4 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Frmpd1A2AKB4 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Frmpd1A2AKB4 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Frmpd1A2AKB4 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Frmpd1A2AKB4 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Frmpd1A2AKB4 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms