Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms