Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col9a3A2ACT7 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms