Protein–RNA interactions for Protein: A2A432

Cul4b, Cullin-4B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 970 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4bA2A432 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cul4bA2A432 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cul4bA2A432 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cul4bA2A432 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cul4bA2A432 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cul4bA2A432 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cul4bA2A432 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cul4bA2A432 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cul4bA2A432 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cul4bA2A432 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cul4bA2A432 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cul4bA2A432 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cul4bA2A432 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cul4bA2A432 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cul4bA2A432 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cul4bA2A432 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cul4bA2A432 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cul4bA2A432 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cul4bA2A432 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cul4bA2A432 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cul4bA2A432 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cul4bA2A432 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cul4bA2A432 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cul4bA2A432 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cul4bA2A432 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cul4bA2A432 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cul4bA2A432 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cul4bA2A432 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cul4bA2A432 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cul4bA2A432 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cul4bA2A432 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cul4bA2A432 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cul4bA2A432 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cul4bA2A432 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cul4bA2A432 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cul4bA2A432 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cul4bA2A432 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cul4bA2A432 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cul4bA2A432 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cul4bA2A432 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cul4bA2A432 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cul4bA2A432 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cul4bA2A432 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cul4bA2A432 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cul4bA2A432 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cul4bA2A432 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cul4bA2A432 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cul4bA2A432 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cul4bA2A432 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Cul4bA2A432 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cul4bA2A432 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cul4bA2A432 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Cul4bA2A432 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cul4bA2A432 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cul4bA2A432 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cul4bA2A432 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cul4bA2A432 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Cul4bA2A432 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cul4bA2A432 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cul4bA2A432 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cul4bA2A432 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cul4bA2A432 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cul4bA2A432 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cul4bA2A432 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cul4bA2A432 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cul4bA2A432 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cul4bA2A432 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cul4bA2A432 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cul4bA2A432 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cul4bA2A432 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cul4bA2A432 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cul4bA2A432 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cul4bA2A432 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cul4bA2A432 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cul4bA2A432 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cul4bA2A432 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cul4bA2A432 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cul4bA2A432 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cul4bA2A432 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cul4bA2A432 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cul4bA2A432 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cul4bA2A432 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cul4bA2A432 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cul4bA2A432 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cul4bA2A432 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cul4bA2A432 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cul4bA2A432 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cul4bA2A432 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cul4bA2A432 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cul4bA2A432 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cul4bA2A432 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cul4bA2A432 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cul4bA2A432 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cul4bA2A432 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cul4bA2A432 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cul4bA2A432 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cul4bA2A432 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cul4bA2A432 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cul4bA2A432 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cul4bA2A432 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.6 ms