Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YYP6

Sirpb1a, Signal-regulatory protein beta 1A, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sirpb1aA0A0A6YYP6 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Sirpb1aA0A0A6YYP6 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Sirpb1aA0A0A6YYP6 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Sirpb1aA0A0A6YYP6 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Sirpb1aA0A0A6YYP6 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Sirpb1aA0A0A6YYP6 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Sirpb1aA0A0A6YYP6 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Sirpb1aA0A0A6YYP6 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Sirpb1aA0A0A6YYP6 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
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Sirpb1aA0A0A6YYP6 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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