Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP6

Gm5538, MCG67716, mousemouse

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Length 401 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5538W4VSP6 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5538W4VSP6 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5538W4VSP6 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5538W4VSP6 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5538W4VSP6 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5538W4VSP6 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5538W4VSP6 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5538W4VSP6 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5538W4VSP6 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5538W4VSP6 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5538W4VSP6 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5538W4VSP6 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5538W4VSP6 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5538W4VSP6 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5538W4VSP6 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5538W4VSP6 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5538W4VSP6 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5538W4VSP6 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5538W4VSP6 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5538W4VSP6 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5538W4VSP6 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5538W4VSP6 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5538W4VSP6 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5538W4VSP6 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5538W4VSP6 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5538W4VSP6 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5538W4VSP6 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5538W4VSP6 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5538W4VSP6 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5538W4VSP6 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5538W4VSP6 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5538W4VSP6 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5538W4VSP6 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5538W4VSP6 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5538W4VSP6 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5538W4VSP6 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5538W4VSP6 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5538W4VSP6 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5538W4VSP6 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5538W4VSP6 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5538W4VSP6 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5538W4VSP6 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5538W4VSP6 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5538W4VSP6 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5538W4VSP6 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5538W4VSP6 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5538W4VSP6 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5538W4VSP6 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5538W4VSP6 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5538W4VSP6 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5538W4VSP6 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5538W4VSP6 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5538W4VSP6 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5538W4VSP6 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5538W4VSP6 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5538W4VSP6 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5538W4VSP6 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5538W4VSP6 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5538W4VSP6 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5538W4VSP6 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Gm5538W4VSP6 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5538W4VSP6 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5538W4VSP6 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5538W4VSP6 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5538W4VSP6 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5538W4VSP6 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5538W4VSP6 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5538W4VSP6 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5538W4VSP6 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5538W4VSP6 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gm5538W4VSP6 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5538W4VSP6 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Gm5538W4VSP6 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5538W4VSP6 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5538W4VSP6 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5538W4VSP6 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5538W4VSP6 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5538W4VSP6 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5538W4VSP6 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5538W4VSP6 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5538W4VSP6 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5538W4VSP6 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5538W4VSP6 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5538W4VSP6 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5538W4VSP6 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5538W4VSP6 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5538W4VSP6 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5538W4VSP6 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5538W4VSP6 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5538W4VSP6 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5538W4VSP6 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5538W4VSP6 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5538W4VSP6 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5538W4VSP6 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5538W4VSP6 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5538W4VSP6 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5538W4VSP6 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5538W4VSP6 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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