Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms