Protein–RNA interactions for Protein: S4R2P9

Slc8a3, Sodium/calcium exchanger 3, mousemouse

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8a3S4R2P9 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc8a3S4R2P9 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc8a3S4R2P9 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc8a3S4R2P9 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc8a3S4R2P9 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc8a3S4R2P9 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc8a3S4R2P9 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc8a3S4R2P9 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc8a3S4R2P9 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc8a3S4R2P9 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc8a3S4R2P9 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc8a3S4R2P9 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc8a3S4R2P9 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc8a3S4R2P9 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc8a3S4R2P9 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc8a3S4R2P9 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc8a3S4R2P9 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc8a3S4R2P9 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc8a3S4R2P9 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc8a3S4R2P9 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc8a3S4R2P9 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc8a3S4R2P9 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc8a3S4R2P9 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc8a3S4R2P9 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc8a3S4R2P9 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc8a3S4R2P9 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc8a3S4R2P9 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc8a3S4R2P9 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc8a3S4R2P9 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc8a3S4R2P9 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc8a3S4R2P9 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc8a3S4R2P9 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc8a3S4R2P9 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc8a3S4R2P9 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc8a3S4R2P9 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc8a3S4R2P9 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc8a3S4R2P9 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc8a3S4R2P9 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc8a3S4R2P9 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc8a3S4R2P9 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc8a3S4R2P9 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc8a3S4R2P9 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc8a3S4R2P9 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc8a3S4R2P9 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc8a3S4R2P9 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc8a3S4R2P9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc8a3S4R2P9 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc8a3S4R2P9 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc8a3S4R2P9 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc8a3S4R2P9 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc8a3S4R2P9 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc8a3S4R2P9 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc8a3S4R2P9 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc8a3S4R2P9 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc8a3S4R2P9 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc8a3S4R2P9 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc8a3S4R2P9 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc8a3S4R2P9 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc8a3S4R2P9 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc8a3S4R2P9 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc8a3S4R2P9 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc8a3S4R2P9 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc8a3S4R2P9 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc8a3S4R2P9 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc8a3S4R2P9 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc8a3S4R2P9 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc8a3S4R2P9 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc8a3S4R2P9 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc8a3S4R2P9 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc8a3S4R2P9 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc8a3S4R2P9 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc8a3S4R2P9 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc8a3S4R2P9 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc8a3S4R2P9 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc8a3S4R2P9 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc8a3S4R2P9 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc8a3S4R2P9 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc8a3S4R2P9 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc8a3S4R2P9 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc8a3S4R2P9 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc8a3S4R2P9 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc8a3S4R2P9 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc8a3S4R2P9 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc8a3S4R2P9 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc8a3S4R2P9 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc8a3S4R2P9 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc8a3S4R2P9 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc8a3S4R2P9 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc8a3S4R2P9 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc8a3S4R2P9 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc8a3S4R2P9 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc8a3S4R2P9 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc8a3S4R2P9 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc8a3S4R2P9 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc8a3S4R2P9 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc8a3S4R2P9 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc8a3S4R2P9 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc8a3S4R2P9 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc8a3S4R2P9 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc8a3S4R2P9 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms